Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Aqp4P55088 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms