Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NcanP55066 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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