Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PctpP53808 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PctpP53808 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms