Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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