Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FmodP50608 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FmodP50608 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FmodP50608 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms