Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfbP49766 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms