Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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