Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms