Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrprbP47758 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms