Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tnfsf9P41274 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tnfsf9P41274 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tnfsf9P41274 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Tnfsf9P41274 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tnfsf9P41274 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tnfsf9P41274 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms