Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lig1P37913 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms