Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms