Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms