Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms