Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprmP28828 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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