Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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