Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pde6aP27664 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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