Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NdnP25233 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms