Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms