Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms