Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms