Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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