Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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PtpraP18052 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PtpraP18052 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms