Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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