Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
DmdP11531 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DmdP11531 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
DmdP11531 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DmdP11531 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms