Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Becn2P0DM65 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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