Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06330 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06330 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06330 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06330 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06330 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P06330 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P06330 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06330 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06330 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06330 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06330 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06330 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06330 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06330 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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