Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms