Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01738 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01738 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01738 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01738 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01738 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01738 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01738 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01738 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01738 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01738 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01738 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01738 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01738 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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