Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a2O54833 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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