Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FxnO35943 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FxnO35943 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms