Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms