Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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