Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1aO35526 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms