Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Degs1O09005 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms