Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EllO08856 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EllO08856 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EllO08856 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EllO08856 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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