Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm4791J3QQ14 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4791J3QQ14 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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