Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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