Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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