Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms