Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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