Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp946F6VWU8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms