Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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