Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
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