Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms