Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ttc17E9PVB5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ttc17E9PVB5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc17E9PVB5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ttc17E9PVB5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ttc17E9PVB5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc17E9PVB5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc17E9PVB5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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