Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmf1B9EKI3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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