Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia1B2RXQ2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia1B2RXQ2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms