Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms