Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms